MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Emticicia oligotrophica DSM 17448 plasmid pEMTOL04

Total Repeats: 620

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018744	AAC	2	6	212	217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671612
2	NC_018744	TCG	2	6	263	268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671612
3	NC_018744	ATG	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
4	NC_018744	GA	3	6	301	306	50 %	0 %	50 %	0 %	408671612
5	NC_018744	CATA	2	8	347	354	50 %	25 %	0 %	25 %	408671612
6	NC_018744	TAC	2	6	379	384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671612
7	NC_018744	TAC	2	6	412	417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671612
8	NC_018744	CAAACA	2	12	422	433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671612
9	NC_018744	TTA	2	6	513	518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671612
10	NC_018744	GAA	2	6	562	567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671612
11	NC_018744	A	6	6	584	589	100 %	0 %	0 %	0 %	408671612
12	NC_018744	AC	3	6	819	824	50 %	0 %	0 %	50 %	408671612
13	NC_018744	A	8	8	832	839	100 %	0 %	0 %	0 %	408671612
14	NC_018744	CAA	2	6	883	888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671612
15	NC_018744	A	8	8	933	940	100 %	0 %	0 %	0 %	408671612
16	NC_018744	A	6	6	967	972	100 %	0 %	0 %	0 %	408671612
17	NC_018744	AGAA	2	8	999	1006	75 %	0 %	25 %	0 %	408671612
18	NC_018744	GAA	3	9	1004	1012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671612
19	NC_018744	TGT	2	6	1054	1059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671612
20	NC_018744	TTGA	2	8	1160	1167	25 %	50 %	25 %	0 %	408671612
21	NC_018744	A	6	6	1182	1187	100 %	0 %	0 %	0 %	408671612
22	NC_018744	GAA	2	6	1250	1255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671612
23	NC_018744	ATG	3	9	1308	1316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
24	NC_018744	T	6	6	1330	1335	0 %	100 %	0 %	0 %	408671612
25	NC_018744	TTCA	2	8	1338	1345	25 %	50 %	0 %	25 %	408671612
26	NC_018744	AAT	2	6	1406	1411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671612
27	NC_018744	CGC	2	6	1477	1482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408671612
28	NC_018744	AGA	2	6	1510	1515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671612
29	NC_018744	AGA	2	6	1552	1557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671612
30	NC_018744	TAAA	2	8	1581	1588	75 %	25 %	0 %	0 %	408671612
31	NC_018744	ATA	2	6	1602	1607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671612
32	NC_018744	TGAT	2	8	1650	1657	25 %	50 %	25 %	0 %	408671612
33	NC_018744	AGAAA	2	10	1673	1682	80 %	0 %	20 %	0 %	408671612
34	NC_018744	GAA	2	6	1685	1690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671612
35	NC_018744	TAT	2	6	1695	1700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671612
36	NC_018744	A	6	6	1727	1732	100 %	0 %	0 %	0 %	408671612
37	NC_018744	AAT	2	6	1787	1792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671612
38	NC_018744	AATT	2	8	1830	1837	50 %	50 %	0 %	0 %	408671612
39	NC_018744	GA	4	8	1874	1881	50 %	0 %	50 %	0 %	408671612
40	NC_018744	CAG	2	6	1917	1922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408671612
41	NC_018744	AAAAG	2	10	1939	1948	80 %	0 %	20 %	0 %	408671612
42	NC_018744	AGT	2	6	1952	1957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
43	NC_018744	GAG	2	6	1958	1963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408671612
44	NC_018744	TTC	2	6	1977	1982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671612
45	NC_018744	AAT	2	6	2017	2022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671612
46	NC_018744	AGT	2	6	2068	2073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
47	NC_018744	ATG	2	6	2088	2093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
48	NC_018744	TAAAGA	2	12	2125	2136	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	408671612
49	NC_018744	GAA	2	6	2216	2221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671612
50	NC_018744	GAT	2	6	2294	2299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
51	NC_018744	A	7	7	2300	2306	100 %	0 %	0 %	0 %	408671612
52	NC_018744	A	6	6	2483	2488	100 %	0 %	0 %	0 %	408671612
53	NC_018744	T	6	6	2515	2520	0 %	100 %	0 %	0 %	408671612
54	NC_018744	TGA	2	6	2592	2597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
55	NC_018744	AT	3	6	2615	2620	50 %	50 %	0 %	0 %	408671612
56	NC_018744	AGG	2	6	2631	2636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408671612
57	NC_018744	T	6	6	2657	2662	0 %	100 %	0 %	0 %	408671612
58	NC_018744	G	6	6	2729	2734	0 %	0 %	100 %	0 %	408671612
59	NC_018744	GGA	2	6	2746	2751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408671612
60	NC_018744	GTG	2	6	2772	2777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408671612
61	NC_018744	A	6	6	2778	2783	100 %	0 %	0 %	0 %	408671612
62	NC_018744	AAT	2	6	2785	2790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671612
63	NC_018744	CTAT	2	8	2808	2815	25 %	50 %	0 %	25 %	408671612
64	NC_018744	T	6	6	2824	2829	0 %	100 %	0 %	0 %	408671612
65	NC_018744	GTA	2	6	2840	2845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
66	NC_018744	GAT	2	6	2846	2851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
67	NC_018744	AAT	2	6	2873	2878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671612
68	NC_018744	TGGGAT	2	12	2936	2947	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	408671612
69	NC_018744	T	6	6	2963	2968	0 %	100 %	0 %	0 %	408671612
70	NC_018744	AGG	2	6	2971	2976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408671612
71	NC_018744	A	6	6	2985	2990	100 %	0 %	0 %	0 %	408671612
72	NC_018744	ATC	2	6	3016	3021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671612
73	NC_018744	GAT	2	6	3053	3058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
74	NC_018744	GA	3	6	3184	3189	50 %	0 %	50 %	0 %	408671612
75	NC_018744	AAC	2	6	3255	3260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671612
76	NC_018744	ATT	2	6	3268	3273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671612
77	NC_018744	GTT	2	6	3281	3286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671612
78	NC_018744	ATG	2	6	3297	3302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
79	NC_018744	GAACCA	2	12	3317	3328	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	408671612
80	NC_018744	TGA	2	6	3331	3336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
81	NC_018744	TAA	2	6	3361	3366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671612
82	NC_018744	GGA	2	6	3397	3402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408671612
83	NC_018744	ATT	2	6	3404	3409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671612
84	NC_018744	TAC	2	6	3426	3431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671612
85	NC_018744	GACG	2	8	3442	3449	25 %	0 %	50 %	25 %	408671612
86	NC_018744	TAAGT	2	10	3463	3472	40 %	40 %	20 %	0 %	408671612
87	NC_018744	ATTA	2	8	3512	3519	50 %	50 %	0 %	0 %	408671612
88	NC_018744	A	8	8	3521	3528	100 %	0 %	0 %	0 %	408671612
89	NC_018744	GGT	2	6	3582	3587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408671612
90	NC_018744	TAA	2	6	3669	3674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671612
91	NC_018744	TGA	2	6	3859	3864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
92	NC_018744	GTA	2	6	3872	3877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
93	NC_018744	GAA	2	6	3884	3889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671612
94	NC_018744	TTA	2	6	3957	3962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671612
95	NC_018744	GAAA	2	8	3974	3981	75 %	0 %	25 %	0 %	408671612
96	NC_018744	TGAA	2	8	3984	3991	50 %	25 %	25 %	0 %	408671612
97	NC_018744	AAAAT	2	10	3995	4004	80 %	20 %	0 %	0 %	408671612
98	NC_018744	GATA	2	8	4030	4037	50 %	25 %	25 %	0 %	408671612
99	NC_018744	TATT	2	8	4051	4058	25 %	75 %	0 %	0 %	408671612
100	NC_018744	CAA	2	6	4090	4095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671612
101	NC_018744	TCTTG	2	10	4178	4187	0 %	60 %	20 %	20 %	408671612
102	NC_018744	TACCT	2	10	4280	4289	20 %	40 %	0 %	40 %	408671612
103	NC_018744	ATG	2	6	4305	4310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
104	NC_018744	CGAA	2	8	4357	4364	50 %	0 %	25 %	25 %	408671612
105	NC_018744	TAA	2	6	4393	4398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671612
106	NC_018744	A	8	8	4407	4414	100 %	0 %	0 %	0 %	408671612
107	NC_018744	CAA	2	6	4418	4423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671612
108	NC_018744	TGAT	2	8	4542	4549	25 %	50 %	25 %	0 %	408671612
109	NC_018744	ATT	2	6	4607	4612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671612
110	NC_018744	GAA	2	6	4641	4646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671612
111	NC_018744	A	6	6	4727	4732	100 %	0 %	0 %	0 %	408671612
112	NC_018744	ATT	2	6	4736	4741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671612
113	NC_018744	GAT	2	6	4894	4899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
114	NC_018744	TAT	2	6	4954	4959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671612
115	NC_018744	ACA	2	6	4974	4979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671612
116	NC_018744	A	8	8	5020	5027	100 %	0 %	0 %	0 %	408671612
117	NC_018744	CAAA	2	8	5070	5077	75 %	0 %	0 %	25 %	408671612
118	NC_018744	ATTTT	2	10	5086	5095	20 %	80 %	0 %	0 %	408671612
119	NC_018744	TGA	2	6	5120	5125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671612
120	NC_018744	AGGA	2	8	5192	5199	50 %	0 %	50 %	0 %	408671613
121	NC_018744	GATT	2	8	5244	5251	25 %	50 %	25 %	0 %	408671613
122	NC_018744	TGC	2	6	5274	5279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671613
123	NC_018744	GATTT	2	10	5293	5302	20 %	60 %	20 %	0 %	408671613
124	NC_018744	A	6	6	5355	5360	100 %	0 %	0 %	0 %	408671613
125	NC_018744	CAAA	2	8	5373	5380	75 %	0 %	0 %	25 %	408671613
126	NC_018744	CAC	2	6	5397	5402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408671613
127	NC_018744	AAC	2	6	5490	5495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671613
128	NC_018744	CCT	2	6	5539	5544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408671613
129	NC_018744	AAT	2	6	5552	5557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671613
130	NC_018744	AAG	2	6	5957	5962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671614
131	NC_018744	GAAG	2	8	6001	6008	50 %	0 %	50 %	0 %	408671614
132	NC_018744	TTCT	2	8	6047	6054	0 %	75 %	0 %	25 %	408671614
133	NC_018744	ATT	2	6	6094	6099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671614
134	NC_018744	TGT	2	6	6102	6107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671614
135	NC_018744	TTGACC	2	12	6194	6205	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408671614
136	NC_018744	CGG	2	6	6375	6380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408671614
137	NC_018744	A	6	6	6393	6398	100 %	0 %	0 %	0 %	408671614
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270	NC_018744	TGCG	2	8	15512	15519	0 %	25 %	50 %	25 %	408671622
271	NC_018744	TGA	2	6	15668	15673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671622
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274	NC_018744	CTG	2	6	15862	15867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671622
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398	NC_018744	TGA	2	6	23433	23438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671627
399	NC_018744	TGC	2	6	23461	23466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671627
400	NC_018744	TGG	2	6	23506	23511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408671627
401	NC_018744	TTG	2	6	23544	23549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671627
402	NC_018744	ATT	2	6	23561	23566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671627
403	NC_018744	GAT	2	6	23642	23647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671627
404	NC_018744	GTG	2	6	23697	23702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408671627
405	NC_018744	AGC	2	6	23743	23748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408671627
406	NC_018744	TGATT	2	10	23923	23932	20 %	60 %	20 %	0 %	408671627
407	NC_018744	ATGC	2	8	23993	24000	25 %	25 %	25 %	25 %	408671627
408	NC_018744	A	6	6	24004	24009	100 %	0 %	0 %	0 %	408671627
409	NC_018744	T	6	6	24147	24152	0 %	100 %	0 %	0 %	408671628
410	NC_018744	TTA	2	6	24187	24192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671628
411	NC_018744	A	7	7	24213	24219	100 %	0 %	0 %	0 %	408671628
412	NC_018744	TTGGGC	2	12	24314	24325	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	408671628
413	NC_018744	ATTA	2	8	24359	24366	50 %	50 %	0 %	0 %	408671628
414	NC_018744	GAT	2	6	24386	24391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671628
415	NC_018744	TCA	2	6	24443	24448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671628
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417	NC_018744	TGA	2	6	24493	24498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671628
418	NC_018744	TGA	2	6	24518	24523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671628
419	NC_018744	TTA	2	6	24538	24543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671628
420	NC_018744	GGT	2	6	24558	24563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408671628
421	NC_018744	TCT	2	6	24624	24629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671628
422	NC_018744	ATT	2	6	24653	24658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671628
423	NC_018744	AGA	2	6	24662	24667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671628
424	NC_018744	GCC	2	6	24687	24692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408671628
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427	NC_018744	GAT	2	6	24771	24776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671628
428	NC_018744	A	8	8	24816	24823	100 %	0 %	0 %	0 %	408671628
429	NC_018744	ATC	2	6	24832	24837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408671628
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431	NC_018744	ATTT	2	8	24903	24910	25 %	75 %	0 %	0 %	408671628
432	NC_018744	T	6	6	25867	25872	0 %	100 %	0 %	0 %	408671629
433	NC_018744	CAA	2	6	25923	25928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408671629
434	NC_018744	T	6	6	25998	26003	0 %	100 %	0 %	0 %	408671629
435	NC_018744	AAT	2	6	26066	26071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671629
436	NC_018744	CTAT	2	8	26102	26109	25 %	50 %	0 %	25 %	408671629
437	NC_018744	TAT	2	6	26173	26178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671629
438	NC_018744	CTG	2	6	26184	26189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671629
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440	NC_018744	GCA	2	6	26216	26221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408671629
441	NC_018744	CTC	2	6	26223	26228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408671629
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484	NC_018744	AATA	2	8	28245	28252	75 %	25 %	0 %	0 %	408671630
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